9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0579 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 418 aa  794    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  47.87 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  46.7 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3001  hypothetical protein  43.05 
 
 		 529 aa  242  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.303389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  40.94 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0207  hypothetical protein  33.06 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  26.93 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  25.81 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  23.62 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>