15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3000 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 426 aa  827    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  59.71 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  55.04 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  47.39 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0341  hypothetical protein  39.15 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0206  hypothetical protein  27.78 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0604666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  23.98 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  31.28 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  24.68 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  26.7 
 
 		 612 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.89 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 668 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.88 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.23 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>