10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0342 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  806    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  41.74 
 
 
418 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0207  hypothetical protein  32.9 
 
 
400 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  36.69 
 
 
612 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  33.06 
 
 
455 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3001  hypothetical protein  34.51 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.303389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  25 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  31.51 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  35.29 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  25.09 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0532904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>