9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3001 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_3001  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1023    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.303389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  53.04 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  45.28 
 
 		 455 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  43.05 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  37.17 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0207  hypothetical protein  27.25 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  24.79 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  31.45 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0341  hypothetical protein  27.33 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>