10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1995 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 455 aa  880    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  46.97 
 
 		 612 aa  300  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  46.7 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3001  hypothetical protein  44.01 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.303389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  34.94 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0207  hypothetical protein  29.89 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  25.54 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  25.63 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  24.11 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  26.64 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>