12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1530 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  100 
 
 
405 aa  792    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  59.22 
 
 
426 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  55.08 
 
 
422 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  47.99 
 
 
414 aa  326  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0341  hypothetical protein  39.28 
 
 
452 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0206  hypothetical protein  29.3 
 
 
481 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0604666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  25.63 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  25.81 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  24.05 
 
 
612 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  26.43 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.53 
 
 
670 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
773 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>