72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2030 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2030  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  65.56 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  60 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  64.44 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2523  multiple resistance and pH regulation protein F  63.33 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  50.59 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  48.68 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  45.45 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  40 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  49.33 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.71 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.17 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  37.5 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  39.53 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.24 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  39.53 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  39.73 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  39.19 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.79 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  41.67 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  34.57 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.75 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2488  multiple resistance and pH regulation protein F  31.76 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.76 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.38 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  38.27 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  41.27 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.94 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  36.11 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  32.43 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  36.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  36 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3536  multiple resistance and pH regulation protein F  49.25 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155575  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  33.78 
 
 		 85 aa  48.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.94 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  37.5 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.41 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4839  multiple resistance and pH regulation protein F  37.88 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  37.14 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.9 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000561435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3293  multiple resistance and pH regulation protein F  32.56 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.24 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  24.71 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  32.18 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  32.18 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  28.57 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  26.83 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  30.34 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0502  multiple resistance and pH regulation protein F  32.86 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119623  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4320  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.41 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.91 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.58 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  27.06 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  35.21 
 
 		 155 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1640  multiple resistance and pH regulation protein F  34.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  34.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  25.88 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  25.88 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  27.91 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  27.06 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1747  multiple resistance and pH regulation protein F  30.23 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2927  multiple resistance and pH regulation protein F  28.41 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  0.611551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0672  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.58 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3280  multiple resistance and pH regulation protein F  32.31 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.99 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  28.89 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  34.25 
 
 		 117 aa  40  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  36.62 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.82 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50690  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>