56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  45.78 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  47.56 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3869  hypothetical protein  47.73 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  53.12 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  50 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  54.24 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.86 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.912377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  42.68 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  48.15 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  44.44 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0166  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.86 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0594  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  44.44 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.04 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  44.44 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18930  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  43.02 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0042  multiple resistance and pH regulation protein F  61.02 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  40.79 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0346  putative cation antiporter subunit  40.58 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.503467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  44.62 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  41.27 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  44.44 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4890  multiple resistance and pH regulation protein F  38.96 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  32.56 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  31.63 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  31.4 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  35.94 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0093627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  40 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.25 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4626  multiple resistance and pH regulation protein F  39.06 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.16 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0212  multiple resistance and pH regulation protein F  42.47 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0498  multiple resistance and pH regulation protein F  50.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  34.09 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  36 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.86 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.43 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  34.25 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2523  multiple resistance and pH regulation protein F  40.32 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  38.24 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  34.25 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.5 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  32.89 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  31.76 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  32.84 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  31.08 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2030  multiple resistance and pH regulation protein F  34.25 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.08 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16760  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  40.28 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0639498  normal  0.0887285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  37.8 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.38 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  31.4 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>