44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_R0058 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_R0058  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0004  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0057  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0057  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0008  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0064  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0081  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0058  tRNA-Phe  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0075  tRNA-Phe  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0053  tRNA-Phe  92.31 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14013  tRNA-Phe  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4351199999999998e-39  hitchhiker  0.00000351067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0063  tRNA-Phe  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111891  normal  0.102996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0058  tRNA-Phe  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.764492  normal  0.700955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0060  tRNA-Phe  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223577  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0005  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0031  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0056  tRNA-Phe  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.131817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  85.07 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  85.07 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0054  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.579409  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0005  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000284912  normal  0.13344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  88 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>