32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0057 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_R0004  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0057  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0057  tRNA-Phe  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0008  tRNA-Phe  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0081  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0058  tRNA-Phe  98.51 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0053  tRNA-Phe  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14013  tRNA-Phe  97.01 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4351199999999998e-39  hitchhiker  0.00000351067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0058  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0060  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223577  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0063  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111891  normal  0.102996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0075  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0058  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.764492  normal  0.700955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0064  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0056  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.131817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  91.04 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  91.04 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0050  tRNA-Phe  85.07 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>