41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0075 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0075  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0064  tRNA-Phe  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0058  tRNA-Phe  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0063  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111891  normal  0.102996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0053  tRNA-Phe  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0008  tRNA-Phe  97.01 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0004  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0060  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223577  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0058  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.764492  normal  0.700955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14013  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4351199999999998e-39  hitchhiker  0.00000351067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0057  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0081  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0056  tRNA-Phe  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.131817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0057  tRNA-Phe  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0058  tRNA-Phe  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117841  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0005  tRNA-OTHER  95.74 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0031  tRNA-OTHER  95.65 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0004  tRNA-Phe  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.359385 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1399  tRNA-Phe  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0050  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>