48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_R0045 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0056  tRNA-Phe  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.131817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  97.37 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0064  tRNA-Phe  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14013  tRNA-Phe  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4351199999999998e-39  hitchhiker  0.00000351067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0058  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0075  tRNA-Phe  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0063  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111891  normal  0.102996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0053  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0008  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0058  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.764492  normal  0.700955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0060  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223577  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0004  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0057  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0081  tRNA-Phe  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0057  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0056  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0504799  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0058  tRNA-Phe  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0005  tRNA-OTHER  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0031  tRNA-OTHER  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1354  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0033  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0051  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0075  tRNA-Phe  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.532419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0056  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0052  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0050  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0006  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0071  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0067  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.687392  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0056  tRNA-Phe  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0006    84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0548782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>