More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00196 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0005  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00223739  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0023  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000132688  unclonable  0.00000666123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0051  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0009  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102248  normal  0.0119324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna57  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000350129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0088  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156507  normal  0.184684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna50  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000949027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0004  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000767494  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t009  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0083  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000277539  normal  0.33634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>