57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3598 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  100 
 
 		 428 aa  838    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  42.22 
 
 		 499 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  40.75 
 
 		 484 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  42.89 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  41.92 
 
 		 406 aa  270  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  42.37 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  43.7 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  40.1 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  38.97 
 
 		 599 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  44.6 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  39.79 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  39.73 
 
 		 563 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  39.15 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  37.91 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  44.16 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  40.53 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  40.64 
 
 		 448 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  38.54 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  43.56 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  40.34 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  40.42 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  41.15 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  45.64 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  41.41 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  41.41 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  34.69 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  30.71 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  41.98 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  39.76 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  31.65 
 
 		 451 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.51 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  31.32 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  30.83 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  28.85 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  29.37 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  24.84 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.09 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25.51 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.86 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  30.24 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  31.52 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  30.28 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  23.92 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  23.35 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.93 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.94 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  26.73 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  24.85 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  24.85 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  21.24 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  25.11 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  26.5 
 
 		 258 aa  46.6  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  21.31 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  22.9 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>