36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0364 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  100 
 
 
365 aa  730    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  43.84 
 
 
361 aa  286  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  39.4 
 
 
372 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  36.41 
 
 
371 aa  235  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  36.54 
 
 
360 aa  209  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  32.36 
 
 
370 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  32.5 
 
 
370 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  32.5 
 
 
370 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  33.06 
 
 
404 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  24.48 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  21.62 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  20.22 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.43 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  23.81 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  24.43 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  23.56 
 
 
434 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  23.97 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  26.42 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  28.44 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  24.19 
 
 
446 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  24.2 
 
 
599 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  27.43 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  21.88 
 
 
451 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  27.94 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  23.14 
 
 
260 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  24.64 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  23.14 
 
 
260 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  25.49 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  22.78 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  22.31 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  27.78 
 
 
386 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  20.9 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  23.36 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  22.86 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  28.95 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  24.35 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>