62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0503 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  78.66 
 
 
261 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  35.04 
 
 
404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  38.14 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  31.67 
 
 
253 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  27.86 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  28.68 
 
 
393 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  26.82 
 
 
396 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  31.3 
 
 
373 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  27.99 
 
 
436 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  32.4 
 
 
382 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  28.29 
 
 
451 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  27.47 
 
 
434 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  26.21 
 
 
385 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  26.72 
 
 
392 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  24 
 
 
397 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  26.94 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  28.73 
 
 
484 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  26.81 
 
 
599 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  26.94 
 
 
513 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.69 
 
 
409 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  27.66 
 
 
413 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  27.75 
 
 
428 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  26.46 
 
 
345 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  85.9  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  26.69 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  27.17 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  23.08 
 
 
416 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  26.2 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  25.31 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  25.7 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  23.58 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  25.91 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  28.19 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  28.33 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  28.33 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  24.74 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  22.04 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  22.91 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.2 
 
 
396 aa  72  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  25.7 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  25.28 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  28.57 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  25.99 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  26.52 
 
 
448 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  24.73 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  24.02 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  22.7 
 
 
386 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  26.95 
 
 
395 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  24.38 
 
 
370 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  24.15 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  22.99 
 
 
365 aa  56.6  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  23.71 
 
 
371 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  20.12 
 
 
447 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  27.08 
 
 
376 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  22.07 
 
 
372 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  22.18 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  25.24 
 
 
360 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  19.31 
 
 
361 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>