62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1617 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  100 
 
 		 382 aa  740    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  39.24 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  39.3 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  42.94 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  36.81 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  36.89 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  36.5 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  33.52 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  39.37 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  35.45 
 
 		 404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  37.62 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  35.29 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  36.31 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  30.23 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  32.9 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  29.81 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  30.13 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  28.48 
 
 		 599 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  32.11 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  31.28 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  25.6 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  32.66 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  29.66 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.24 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  28.19 
 
 		 563 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  32.39 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  25.96 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  28.4 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  26.34 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  26.56 
 
 		 448 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  33.88 
 
 		 261 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  27.25 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  27.38 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  30.2 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  26.95 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  26.32 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  28.44 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  26.27 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  28.44 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  31.33 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  31.33 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  24.76 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  26.92 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  27.95 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  25.46 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  23.21 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  24.01 
 
 		 480 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  25.62 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  25.42 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  26.91 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  26.91 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  25.43 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  30.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  30.09 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  23.36 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  28.29 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  24.27 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  30.61 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  28.92 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  27.56 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  24.23 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  22.75 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>