37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0110 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  100 
 
 		 360 aa  723    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  41.16 
 
 		 371 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  36.54 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  36.48 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  32.55 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  32.55 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  32.73 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  33.05 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  23.01 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  22.36 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  24.74 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  23.54 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.62 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25.61 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  21.38 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  25.51 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  26.62 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.85 
 
 		 409 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  31.61 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  25.79 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  21.82 
 
 		 451 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  22.58 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  21.94 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  25.45 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  20.37 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.62 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  20.56 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  23.64 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  25.15 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  21.3 
 
 		 599 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  27.97 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  29.33 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  23.61 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  24.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  21.81 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>