55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0444 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  85.52 
 
 		 449 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  100 
 
 		 448 aa  862    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  47.18 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  47.11 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  45.78 
 
 		 513 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  42.93 
 
 		 599 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  38.9 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  39.55 
 
 		 563 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  41.73 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  36.48 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  41.25 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  38.58 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  41.55 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  41.44 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  35.64 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  43.44 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  43.19 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  43.19 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  36.54 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  42.82 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  42.19 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  38.19 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  39.4 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  42.46 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  32.44 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  37.85 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  40.51 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  41.86 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  36.23 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  33.21 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  30.89 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  34.14 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  23.87 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  28.03 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  29.52 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  26.51 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  31.42 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  29.35 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  24.46 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  26.48 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  33.18 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  26.76 
 
 		 416 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  28.34 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.73 
 
 		 381 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.75 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  26.84 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  20.55 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  27.4 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  22.74 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  22.74 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  21.78 
 
 		 371 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  23.3 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>