More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3162 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3162  aldo/keto reductase  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2541  aldo/keto reductase  59.44 
 
 
287 aa  327  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0303  aldo/keto reductase  59.79 
 
 
287 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3379  aldo/keto reductase  59.11 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6285  aldo/keto reductase  55.1 
 
 
297 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53.22 
 
 
293 aa  272  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.883997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0107  aldo/keto reductase  52.88 
 
 
294 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.290667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05950  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.93 
 
 
294 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0134  aldo/keto reductase  46.57 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0113051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2096  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
291 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000962539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0214  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  45.3 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0168  aldo/keto reductase  50.17 
 
 
294 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1063  putative oxidoreductase  45.77 
 
 
287 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5332  aldo/keto reductase  45.88 
 
 
291 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4482  aldo/keto reductase  44.09 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
300 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0776  putative oxidoreductase  41.11 
 
 
312 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
335 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
289 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  39.72 
 
 
287 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  39.15 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  39.15 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
286 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  37.63 
 
 
284 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  39.79 
 
 
287 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  38.79 
 
 
292 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
283 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  42.76 
 
 
285 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  39.93 
 
 
284 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  34.39 
 
 
324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  36.92 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  36.04 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  37.59 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  36.3 
 
 
300 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  35.34 
 
 
293 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
296 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  35.82 
 
 
304 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
335 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
326 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  35.44 
 
 
281 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  36.33 
 
 
328 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  34.64 
 
 
328 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  36.33 
 
 
288 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
329 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
328 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
327 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
287 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
293 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  35.2 
 
 
331 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
285 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  34.4 
 
 
334 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  32.6 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  35.78 
 
 
327 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  36.56 
 
 
280 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
330 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  33.86 
 
 
327 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  37.37 
 
 
289 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
326 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
329 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
328 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  31.86 
 
 
321 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  33.92 
 
 
286 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
281 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
309 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  34.08 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  35.39 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  34.06 
 
 
331 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
331 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
328 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
326 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  35.94 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
330 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
328 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  31.95 
 
 
327 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  36.91 
 
 
328 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  34.6 
 
 
325 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
340 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
327 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
338 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
328 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
328 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  35.46 
 
 
333 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
333 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  34.52 
 
 
320 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
334 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  34.01 
 
 
327 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>