More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0214 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0214  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  100 
 
 		 287 aa  598  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1063  putative oxidoreductase  78.4 
 
 		 287 aa  481  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0776  putative oxidoreductase  54.33 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0303  aldo/keto reductase  50.18 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2541  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3379  aldo/keto reductase  49.1 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3162  aldo/keto reductase  45.3 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6285  aldo/keto reductase  45.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05950  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.49 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.2 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.883997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0107  aldo/keto reductase  40.83 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.290667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0134  aldo/keto reductase  40 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0113051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0168  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2096  aldo/keto reductase  35.74 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000962539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4482  aldo/keto reductase  36.36 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  35.87 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  34.51 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  32.52 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  36.28 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  34.28 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  34.59 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  34.28 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  36.18 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  34.28 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  35.5 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  34.26 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  32.86 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  33.57 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  32.51 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  34.28 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  34.18 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.28 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  34.6 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  32.51 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.65 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  34.04 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  32.7 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  32.49 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  32.69 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  32.18 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  32.8 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 449 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.69 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  32.28 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5332  aldo/keto reductase  33.79 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  32.46 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  33.57 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  32.36 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  32.29 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  32.8 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  32.91 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  32.06 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  31.47 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  29.07 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  34.19 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  30.58 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  32.75 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  31.85 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  32.98 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  32.37 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  31.66 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  32.04 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  31.56 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  34.4 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  32.7 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  31.31 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  30.96 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  33.11 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  32.48 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  29.65 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  30.53 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  33.54 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  30.99 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  31.73 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  30.58 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  33.33 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  30.35 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  30.41 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>