22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1213 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1213  TadE family protein  100 
 
 		 163 aa  309  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  42.31 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  42.02 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  40.16 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  32.5 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  32.52 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  42.64 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  35.53 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  35.29 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  34.62 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.82 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  32.17 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  41.3 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  32.31 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  32.31 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  38.89 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  32.31 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  30.77 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  31.86 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  32.43 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  32.81 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>