38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1256 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  100 
 
 		 127 aa  239  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  51.72 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  47.41 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  54.17 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  49.18 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  44.26 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  42.34 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  38.52 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  42.45 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  44.07 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1239  TadE family protein  45.88 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  37.5 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0860  TadE family protein  31.53 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  29.41 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  32 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.92 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  47.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  47.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  35 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  25.6 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  35.42 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  35.42 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  38.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  38.6 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  26.56 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  26.53 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40.43 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  33.85 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  39.06 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  37.1 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.57 
 
 		 189 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>