18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0783 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  100 
 
 		 171 aa  326  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  76.42 
 
 		 152 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  40.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  37.29 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  44.12 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  40.77 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  34.23 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1213  TadE family protein  42.86 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  43.09 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  32.79 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  31.63 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  33.75 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  35.19 
 
 		 278 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0860  TadE family protein  30.95 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  44.68 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.37 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40.82 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>