21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2404 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  100 
 
 
138 aa  269  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  80.17 
 
 
122 aa  194  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  49.58 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  47.01 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  51.72 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  39.2 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  41.67 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1239  TadE family protein  45.45 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547087  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  33.96 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0860  TadE family protein  33.94 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  45 
 
 
336 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  39.47 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  28.28 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  29.25 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  29.25 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  29.25 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  27.78 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  31.03 
 
 
180 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  30.3 
 
 
148 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  31.58 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>