28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2669 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  80.17 
 
 
138 aa  194  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1029  TadE family protein  47.41 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2787  TadE family protein  51.72 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  hitchhiker  0.000960754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07540  TadE-like protein  38.79 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1256  TadE family protein  47.41 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1239  TadE family protein  44.32 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547087  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20380  hypothetical protein  36.79 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0860  TadE family protein  34.17 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  65.22 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  41.67 
 
 
336 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10360  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143817  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  29.52 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  28.12 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  27.62 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  26.77 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  29.27 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  26.77 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  26.77 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0783  TadE-like  37.17 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  33.85 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.85 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  31.94 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  31.94 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.76 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  31.46 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  27.46 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  28.57 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>