36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2421 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2421    100 
 
 		 2108 bp  4179    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.982753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  97.81 
 
 		 1058 bp  1237    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    100 
 
 		 3322 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  100 
 
 		 1058 bp  1370    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1951    88.61 
 
 		 3837 bp  170  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8432    81.87 
 
 		 549 bp  105  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2720  Glutathione S-transferase domain  98.04 
 
 		 279 bp  93.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.878821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8619    80.63 
 
 		 505 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.12 
 
 		 1061 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.12 
 
 		 1061 bp  85.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  79.03 
 
 		 537 bp  60  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4603    80.56 
 
 		 316 bp  58  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  89.58 
 
 		 438 bp  56  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  92.31 
 
 		 225 bp  54  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  90.48 
 
 		 276 bp  52  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  88.89 
 
 		 546 bp  50.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  88.89 
 
 		 564 bp  50.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  88.64 
 
 		 1070 bp  48.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1660    88.64 
 
 		 2588 bp  48.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  88.64 
 
 		 1070 bp  48.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  88.64 
 
 		 1070 bp  48.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  88.64 
 
 		 546 bp  48.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3225    88.64 
 
 		 2588 bp  48.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.41764  normal  0.522929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>