41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8432 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8432    100 
 
 		 549 bp  1088    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8619    90.2 
 
 		 505 bp  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  89.31 
 
 		 537 bp  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  86.61 
 
 		 549 bp  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.43 
 
 		 1061 bp  113  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.43 
 
 		 1061 bp  113  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  78.68 
 
 		 438 bp  107  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2421    81.87 
 
 		 2108 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.982753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    81.87 
 
 		 3322 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  81.87 
 
 		 1058 bp  105  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  81.35 
 
 		 1058 bp  97.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  87.78 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  87.78 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  87.78 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  87.78 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  87.78 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  80.98 
 
 		 1058 bp  87.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  80.75 
 
 		 324 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  100 
 
 		 546 bp  73.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  100 
 
 		 546 bp  73.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4603    92.31 
 
 		 316 bp  71.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8327    84.34 
 
 		 395 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1174    85.33 
 
 		 556 bp  61.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8605    94.59 
 
 		 527 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  89.8 
 
 		 564 bp  58  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  93.94 
 
 		 546 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 1653 bp  50.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  87.76 
 
 		 225 bp  50.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  77.09 
 
 		 405 bp  46.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>