24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4603 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4603    100 
 
 
316 bp  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1174    94.74 
 
 
556 bp  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  95.05 
 
 
405 bp  159  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8619    96.15 
 
 
505 bp  87.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8432    92.31 
 
 
549 bp  71.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  87.14 
 
 
549 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2421    80.56 
 
 
2108 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.982753  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    80.56 
 
 
3322 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  80.56 
 
 
1058 bp  58  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  84.72 
 
 
1058 bp  56  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  84.29 
 
 
537 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  96.67 
 
 
324 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>