39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8619 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8619    100 
 
 		 505 bp  1001    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8432    90.2 
 
 		 549 bp  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  86.61 
 
 		 537 bp  454  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  85.85 
 
 		 549 bp  424  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  79.95 
 
 		 438 bp  147  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.93 
 
 		 1061 bp  117  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.93 
 
 		 1061 bp  117  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  82.07 
 
 		 324 bp  103  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  84.43 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  84.43 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  84.43 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  84.43 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  84.43 
 
 		 885 bp  91.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4603    96.15 
 
 		 316 bp  87.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1174    83.87 
 
 		 556 bp  87.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    80.63 
 
 		 3322 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2421    80.63 
 
 		 2108 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.982753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  80.63 
 
 		 1058 bp  85.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  83.06 
 
 		 405 bp  79.8  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  80.1 
 
 		 1058 bp  77.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  79.67 
 
 		 1058 bp  67.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  92.68 
 
 		 225 bp  58  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8327    80.83 
 
 		 395 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2460  fumarate reductase iron-sulfur subunit  93.94 
 
 		 744 bp  50.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  88.64 
 
 		 276 bp  48.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  96.3 
 
 		 945 bp  46.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4015  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  96.3 
 
 		 1392 bp  46.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>