19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3225 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  100 
 
 		 1140 bp  2260    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3225    100 
 
 		 2588 bp  5130    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.41764  normal  0.522929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  98.05 
 
 		 1070 bp  1029    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  100 
 
 		 1140 bp  2260    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1660    98.76 
 
 		 2588 bp  4855    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  99.64 
 
 		 1070 bp  1100    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  98.05 
 
 		 1070 bp  1029    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  92.18 
 
 		 1070 bp  767    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2955    93.1 
 
 		 396 bp  167  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.175748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  85.93 
 
 		 771 bp  117  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  85.93 
 
 		 564 bp  117  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  88.75 
 
 		 510 bp  87.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  92.86 
 
 		 1061 bp  79.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  92.86 
 
 		 1061 bp  79.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  90.57 
 
 		 549 bp  65.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  85 
 
 		 510 bp  63.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  93.02 
 
 		 276 bp  61.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8327    86.57 
 
 		 395 bp  61.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  89.13 
 
 		 225 bp  52  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>