17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1951 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1951    100 
 
 		 3837 bp  7606    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1137 bp  2254    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2421    88.61 
 
 		 2108 bp  170  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.982753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6409    79.94 
 
 		 624 bp  125  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  82.43 
 
 		 1605 bp  123  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3928    81.36 
 
 		 1375 bp  111  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  82.29 
 
 		 1338 bp  101  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  80.45 
 
 		 1335 bp  95.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4240    82.29 
 
 		 739 bp  93.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  83.1 
 
 		 1257 bp  83.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  83.1 
 
 		 1257 bp  83.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3766  hypothetical protein  82.83 
 
 		 261 bp  61.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2720  Glutathione S-transferase domain  91.49 
 
 		 279 bp  61.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.878821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0041  ABC transporter related  96.77 
 
 		 876 bp  54  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2676  putative transposase  85.33 
 
 		 687 bp  54  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.376516  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0251  putative transposase  85.33 
 
 		 687 bp  54  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  85.25 
 
 		 1302 bp  50.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>