11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3928 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  84.41 
 
 		 1338 bp  985    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3928    100 
 
 		 1375 bp  2726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  95.59 
 
 		 1335 bp  2175    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2800    83.24 
 
 		 823 bp  347  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1951    81.36 
 
 		 3837 bp  111  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  90.32 
 
 		 1257 bp  75.8  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  90.32 
 
 		 1257 bp  75.8  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4240    89.8 
 
 		 739 bp  58  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4814    82.95 
 
 		 303 bp  56  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0251  putative transposase  96.67 
 
 		 687 bp  52  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2676  putative transposase  96.67 
 
 		 687 bp  52  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.376516  normal  0.169347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>