55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0832 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0832  putative esterase  100 
 
 
314 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0357048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10530  hypothetical protein  39.92 
 
 
300 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1609  putative esterase  43.88 
 
 
275 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10789  hypothetical protein  42.31 
 
 
303 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5149  putative esterase  43.88 
 
 
275 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2441  putative esterase  39.92 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4658  putative esterase  41.38 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4953  putative esterase  41.38 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.154842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4570  putative esterase  41.38 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  38.06 
 
 
307 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1156  putative esterase  28.4 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12230  hypothetical protein  31.94 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  28.85 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  31.45 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  27.08 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  32.4 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  25.91 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  25.91 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  25.91 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.75 
 
 
640 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  27.95 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  26.09 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  26.09 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3396  putative esterase  26.3 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0735917  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  26.45 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  25.48 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  25.57 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  25.36 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  24.43 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  22.05 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  26.87 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  26.87 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  25.55 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  23.16 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  23.73 
 
 
299 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  26.43 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  26.78 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  26.78 
 
 
282 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  26.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  26.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  26.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  26.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  26.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  26.88 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  32.28 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  27.15 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  25.79 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  31.71 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  27.46 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  25.93 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  23.14 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  28.06 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  31.82 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  24 
 
 
255 aa  42.7  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>