17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12230  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1156  putative esterase  43.24 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  36.68 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10789  hypothetical protein  33.18 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10530  hypothetical protein  33.82 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5149  putative esterase  33.49 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1609  putative esterase  32.25 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2441  putative esterase  31.43 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4570  putative esterase  31.34 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4953  putative esterase  31.34 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.154842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4658  putative esterase  31.34 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0832  putative esterase  31.48 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0357048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  30.23 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  25.47 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  25.24 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  26.04 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  21.89 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>