27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1156 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1156  putative esterase  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12230  hypothetical protein  43.75 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10789  hypothetical protein  33.22 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5149  putative esterase  36.57 
 
 
275 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1609  putative esterase  36.28 
 
 
275 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  34.35 
 
 
307 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2441  putative esterase  31.6 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10530  hypothetical protein  34.82 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4570  putative esterase  33.48 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4658  putative esterase  33.48 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4953  putative esterase  33.48 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.154842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0832  putative esterase  27.98 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0357048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  28.45 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.45 
 
 
640 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  24.63 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  26.05 
 
 
268 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  24.9 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  23.26 
 
 
291 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  25.9 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  27.39 
 
 
299 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  36.96 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  30.08 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  21.5 
 
 
341 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2282  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.989795  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  23.4 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  23.4 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  24.54 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>