23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0516 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  242  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  46.34 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  45.69 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  38.26 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  35.09 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  40.22 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  30.16 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  33.61 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  29.82 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  40.45 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  32.99 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  42.57 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  32.79 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  26.36 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  24.35 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>