23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3287 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  316  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  64.18 
 
 
129 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  38.82 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  37.93 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  30.19 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  32.08 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  31.93 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  36.08 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  35.65 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  31.78 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  37.8 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02015  hypothetical protein  40.35 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  26.67 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  26.45 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  34.83 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  38.24 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17930  hypothetical protein  36.73 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  30.83 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>