17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  338  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  46.23 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  44.23 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  34.31 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  38.3 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  33.64 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  29.81 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  33.93 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  34.86 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  31.73 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  36.19 
 
 		 125 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  26.4 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  33.63 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>