12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8074 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  34.51 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  31.5 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  35.71 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  30.71 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  33.06 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  30.71 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  30.58 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  35.9 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  29.27 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  30.43 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  28.78 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>