22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0448 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  41.53 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  45.05 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  37.86 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  39.45 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  40.54 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  33.96 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  36.45 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  36.45 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  36.89 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  30.95 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  33.68 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  28.23 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  32.8 
 
 
133 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  40.23 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  29.82 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  32.38 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  31.43 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2781  hypothetical protein  49.18 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0938357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  30.93 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  38.37 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>