16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6116 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  275  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  54.74 
 
 
141 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  31.5 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  35.16 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  34.51 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  29.23 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  29.41 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  34.65 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  30.3 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  41.43 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  28.45 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  29.75 
 
 
150 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>