20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3250 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  288  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  40.57 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  37.89 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  41.05 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  45.12 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  38.83 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  29.37 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  36.46 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  39.47 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  39.18 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  37.14 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  26.92 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2001  ABC transporter related  44.07 
 
 		 418 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.985139  hitchhiker  0.00587688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17930  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>