14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2070 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  64.84 
 
 		 129 aa  171  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  47.62 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  44.88 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  47.62 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  40.15 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  39.64 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  38.84 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  34.26 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  34.4 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  31.62 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  27 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  27.52 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>