13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1060 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1060  TadE family protein  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  73.47 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  34.19 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.95 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  24.06 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  25.35 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  27.48 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1103  TadE family protein  28.03 
 
 		 164 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576776  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  26.36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  35.85 
 
 		 580 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03345  hypothetical protein  28.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  21.8 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  34.62 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>