13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3201 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  100 
 
 		 148 aa  303  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1060  TadE family protein  73.47 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  38.56 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  26.32 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  24.53 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  29.77 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.67 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1103  TadE family protein  32.03 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576776  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  25 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  23.48 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  26.81 
 
 		 185 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  24.46 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  24.31 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>