38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2693 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2693  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2404  protein of unknown function DUF34  37.4 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2075  hypothetical protein  37.74 
 
 
293 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000709119  hitchhiker  0.000128648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6084  protein of unknown function DUF34  39.45 
 
 
305 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0315  protein of unknown function DUF34  34.94 
 
 
268 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339615  hitchhiker  0.000633283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1930  protein of unknown function DUF34  38.62 
 
 
268 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0037  hypothetical protein  32.59 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  27.31 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  25.63 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  25.63 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  25.32 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  26.88 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  26.1 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  26.38 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  25.11 
 
 
256 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  27.2 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  24.38 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  27.04 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  30.22 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  24.66 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  26.36 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  25.88 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  25 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  24.46 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  25 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  24.31 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  22.18 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1203  protein of unknown function DUF34  23.76 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  24.22 
 
 
263 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  28.45 
 
 
291 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  22.27 
 
 
247 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>