24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2404 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2404  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 287 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6084  protein of unknown function DUF34  55.68 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2693  protein of unknown function DUF34  37.4 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2075  hypothetical protein  37.23 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000709119  hitchhiker  0.000128648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0315  protein of unknown function DUF34  32.44 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339615  hitchhiker  0.000633283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0037  hypothetical protein  34.2 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1930  protein of unknown function DUF34  29.67 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  28.38 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  28.11 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27.65 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  28.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  28.51 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  28.51 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  25.27 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  28.07 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  22.82 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  24.65 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  24.22 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  28.03 
 
 		 371 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>