23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6084 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6084  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 305 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2404  protein of unknown function DUF34  55.68 
 
 		 287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2075  hypothetical protein  39.18 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000709119  hitchhiker  0.000128648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2693  protein of unknown function DUF34  39.45 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0315  protein of unknown function DUF34  35.09 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339615  hitchhiker  0.000633283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0037  hypothetical protein  35.69 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1930  protein of unknown function DUF34  29.18 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  27.27 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  25 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  24.54 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  23.81 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  31.5 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  23.22 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  26.46 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  25.91 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  21.52 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  26.56 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  31.68 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  31.93 
 
 		 372 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  22.56 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  28.46 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  23.72 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>