45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0947 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  59.72 
 
 
216 aa  244  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  47.73 
 
 
219 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  47.25 
 
 
217 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  44.76 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  44.76 
 
 
218 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  43.54 
 
 
213 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  44.29 
 
 
213 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  43.06 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  44.29 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  43.4 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  43.4 
 
 
213 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  43.4 
 
 
213 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  43.4 
 
 
213 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  44.29 
 
 
216 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  44.16 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  44.35 
 
 
230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  43.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  43.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  43.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  43.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  44.78 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  43.48 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  44.24 
 
 
216 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  44.16 
 
 
230 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  44.16 
 
 
230 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  40.4 
 
 
192 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  42.78 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  38.22 
 
 
173 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  36.56 
 
 
155 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  37.1 
 
 
155 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  36.56 
 
 
168 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  68.57 
 
 
168 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  36.56 
 
 
168 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  37.82 
 
 
179 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  67.14 
 
 
168 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  33.48 
 
 
211 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  60.87 
 
 
91 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  27.01 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>